Program Studi S1 Kedokteran menyediakan laboratorium pembelajaran yang digunkanan untuk menunjang proses pembelajaran dan meningkatkan skill mahasiswa agar menjadi lulusan yang profesional, diantaranya:

Praktikum Histologi merupakan praktikum yang mengembangkan bidang pendidikan dan penelitian di bidang mikroskopis jaringan normal dan organ. Sedangkan, praktikum Patologi Anatomi merupakan praktikum yang menunjang pembelajaran dan penelitian yang berkaitan dengan studi organ dan jaringan tubuh. Bidang patologi anatomi berperan untuk mendeteksi adanya kelainan jaringan dalam tubuh dan penapisan suatu penyakit.

Laboratorium Fisiologi merupakan fasilitas penunjang akademik yang dirancang untuk mendukung proses pembelajaran, penelitian, dan pengembangan ilmu di bidang fisiologi manusia. Dengan peralatan yang lengkap dan teknologi terkini, laboratorium ini menjadi ruang ideal untuk mengamati, memahami, dan menganalisis berbagai fungsi biologi tubuh secara ilmiah.

Laboratorium Unggulan (Kesehatan Masyarakat & Komunitas) merupakan laboratorium yang digunakan untuk menunjang ilmu kesehatan masyarakat dan komunitas yang dapat dipergunakan juga sebagai laboratorium unggulan dalam prevensi diabetes melitus. Laboratorium ini memiliki kapasitas 25 orang mahasiswa. Guna menunjang pembelajaran, laboratorium unggulan (kesehatan masyarakat dan komunitas) dilengkapi dengan alat-alat untuk kegiatan praktikum.

Laboratorium Mikrobiologi dan Parasitologi merupakan fasilitas penunjang untuk mendukung proses pembelajaran mahasiswa dalam memahami karakteristik mikroorganisme penyebab penyakit, teknik isolasi dan identifikasi mikroba, serta uji sensitivitas antibiotik. Selain itu, laboratorium juga berperan dalam menunjang penelitian terkait infeksi, resistensi antimikroba, dan pengembangan terapi. Laboratorium mikrobiologi menjadi komponen penting dalam mencetak tenaga medis yang kompeten dalam diagnosis dan penatalaksanaan penyakit infeksi.

Laboratorium Anatomi Fakultas Kedokteran Universitas Alma Ata merupakan salah satu sarana pembelajaran utama dalam mendukung pendidikan kedokteran dasar. Laboratorium ini dilengkapi dengan berbagai fasilitas modern, seperti model anatomi 3D, preparat kering dan basah termasuk pengadaan pembelajaran menggunakan Cadaver, serta media digital interaktif yang menunjang proses pembelajaran anatomi manusia secara komprehensif. Di laboratorium ini, mahasiswa mempelajari struktur dan hubungan antar organ tubuh manusia melalui pendekatan visual, praktikal, dan integratif, guna memahami dasar-dasar ilmu kedokteran secara mendalam. Didukung oleh tenaga pengajar profesional dan kurikulum berbasis kompetensi, laboratorium anatomi ini bertujuan mencetak lulusan kedokteran yang memiliki pemahaman anatomi yang kuat dan aplikatif dalam praktik klinis.

Laboratorium Farmakologi digunakan untuk kegiatan praktikum dan penelitian di bidang farmakologi untuk menilai efektivitas dan keamanan suatu produk melalui uji aktivitas dan keamanan senyawa obat. Mahasiswa juga mempelajari ilmu farmakologi farmasi, perjalanan obat setelah diberikan kedalam tubuh mengalami absorbs, distribusi, metabolisme dan ekskresi, serta bagaimana pengaruhnya terhadap tubuh. Laboratorium Biologi Molekuler merupakan laboratorium yang menunjang kegiatan pembelajaran dan penelitian di bidang biologi sel dan molekuler. Bidang biologi sel dan molekuler mempelajari tentang molekul asam nukleat (DNA/RNA) dan protein.

Laboratorium yang digunakan untuk mempersiapkan keterampilan klinis mahasiswa kedokteran dan profesi kedokteran dengan dapat meningkatkan kemampuan dalam komunikasi, pemeriksaan fisik, tindakan medis serta prosedur invasive (pada manekin).

Laboratorium Biokimia dan Patologi Klinik merupakan laboratorium yang digunakan mahasiswa kedokteran Universitas Alma Ata yang berfungsi untuk menunjang kegiatan praktikum dan penelitian dalam bidang biokimia serta patologi klinik di dukung dengan teknologi terkini guna mendukung kompetensi akademik dan keterampilan profesional mahasiswa. Laboratorium ini memiliki kapasitas 25 orang mahasiswa.

Laboratorium Computer Based Test & Fisiologi Digital adalah laboratorium yang dibangun dengan teknologi canggih, PC berspesifikasi tinggi, server yang berkapasitas besar, dan jaringan yang memadai. Lab ini dipergunakan untuk praktikum bidang komputerisasi di prodi Kedokteran seperti aplikom dll, dan juga dipergunakan untuk ujian daring atau biasa disebut Ujian CBT baik itu CBT internal Ujian yang ada di lingkungan Universitas Alma Ata maupun ujian eksternal seperti Ujian Kompetensi bidang kesehatan.